隨著化肥的添加，土壤結構遭到破壞，土壤環境受到污染，土壤營養逐漸失衡，問題越來越嚴重。尤其是對土壤氮、磷、鉀三元素的影響更為突出。一般建議使用三體儀進行土壤微量元素檢測，以獲得土壤中各種養分的含量參數，為施肥提供科學有力的依據。

土壤微量元素檢測結果表明，過量使用化肥導致大量NH4、K與土壤膠體吸附的Ca2、Mg2等陽離子發生交換，破壞土壤結構，導致土壤板結。大量施用化肥，導致土壤有機質減少。化肥無法彌補有機質的不足，進一步影響土壤微生物的生存，不僅破壞了土壤肥力結構，還降低了肥效。

礦物原料和化肥用化學原料含有多種重金屬元素、放射性物質等有害成分，隨著施肥進入農田土壤形成污染。近年來，土壤污染日益嚴重，影響了農產品的營養價值、耐貯性和抗逆性，進而影響了人類健康。

土壤微量元素檢測儀測定長期使用氮、磷、鉀后的土壤營養，發現N-P-K營養對土壤結構產生了適當的破壞力，導致土壤營養失衡，營養流失，污染加劇。根據不同作物和土壤類型，平衡科學配方施肥，結合使用和營養，大力實施/計量、生產、供應、施用一體化的農化服務，從根本上改善土壤結構，培肥土壤，提高化肥和有機肥的吸收利用率，保持土壤肥力的長期利用。這不僅可以節約生產成本，提高作物產值，提高產品質量，還可以維護農業生態環境，進而提高農產品質量，真正增加農產品數量，實現高產、穩產、適地、高產。

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